1、抗菌
穿心蓮中含有豐富的新穿心蓮內酯，這種物質對于細菌性痢疾的治療是非常有幫助的，而沒有副作用和毒性。體外試驗，穿心蓮水煎劑及從其中分離出之粗結晶，均對鉤端螺旋體的某些型別有抑制或殺滅作用，煎劑對肺炎球菌、甲鏈球菌及卡他球菌有一定抑制作用。
2、抗病毒
穿心蓮煎劑對孤兒病毒ECHO11引起的人胚腎細胞的退變有延緩作用。穿心蓮在體外試驗有一定的抗HIV作用。
3、解熱消炎
穿心蓮有著非常不錯的解熱作用，對于實驗性炎癥有顯著的抑制作用。而且穿心蓮有著非常好的消炎作用。臨床上曾應用于多種感染性疾病，包括外傷感染、癤、癰、丹毒、上呼吸道感染、急慢性扁桃體炎、急慢性咽喉炎、急慢性支氣管炎、急性菌痢、急性胃腸炎、尿路感染、子宮內膜炎、盆腔炎、中耳炎、牙周炎等，均有不同程度的療效。
4、清化濕熱
用于濕熱泄瀉、濕熱黃疸、熱淋帶下。濕熱泄瀉，癥見急性腸炎、腹痛、瀉下急迫、勢如水注、黃褐而臭、肛門灼熱，可與黃連、滑石、白扁豆等同用。濕熱黃疸，癥見目睛皮膚俱黃、小便黃赤、脘腹脹滿、上腹脹痛、惡心嘔吐，可與黃連、梔子、茵陳、赤芍等同用;濕熱下注、熱淋、小便澀痛，可與黃連、滑石等同用。穿心蓮對于治療濕熱帶下也是非常不錯的，癥見帶下黃白黏稠或黃水樣、瘙癢，通常情況下會與與芡實、金櫻子、黃柏、苦參同用。
5、免疫抑制
穿心蓮對人體的免疫功能的影響比較復雜。水煎劑、內酯注射液、甲素注射液均篚增強小鼠巨噬細胞和外周白細胞的吞噬作用。穿心蓮抗感染的臨床療效可能與此有關。穿心蓮內酯能使小鼠胸腺萎縮，外周T細胞減少，能降低血清中抗體效價，抑制遲發型超敏反應，表明穿心蓮內酯對T細胞和B細胞均有抑制作用，是一種免疫抑制劑。
7、抗栓
穿心蓮黃酮成分有抗血小板聚集，改善血液黏稠度，抗血栓形成能作用，有增加心肌血流量，抗心肌梗死的作用。
8、保肝利膽
穿心蓮內酯對肝損傷有顯著的對抗作用，能使血清ALT、ASTAKP、SB和肝內甘油三酯下降。穿心蓮內酯還有顯著的利膽作用。
9、抗蛇毒
本品有顯著的抗蛇毒作用，印度民間用于蛇傷有效。